生男孩女孩与基因有一定关系，但主要取决于父亲的精子携带的性染色体类型。胎儿性别由受精时精子携带的X或Y染色体决定，X染色体与卵子结合发育为女孩，Y染色体结合则发育为男孩。基因因素可能通过影响精子活性或受精环境间接影响性别概率，但无法直接控制。
男性精子中X和Y染色体的比例理论上均等，但Y染色体精子更小、游动更快，在碱性环境中存活率略高。某些遗传性疾病如血友病、红绿色盲等与X染色体相关，携带致病基因的父亲可能通过性别选择生育降低遗传风险，但这属于极特殊情况。部分研究显示，母体生殖道酸碱度、排卵期同房时间等因素可能轻微影响两种精子的受精机会。
极少数情况下，基因突变可能导致性染色体异常，例如克氏综合征或特纳综合征，这类疾病会影响胎儿性别发育。某些家族存在性别比例失衡现象，可能与Y染色体微缺失或精子发生基因变异有关，但这类情况概率极低且需专业基因检测确认。自然受孕中，基因对性别的直接影响非常有限，环境因素和随机概率仍是决定性因素。
备孕夫妇无须过度关注胎儿性别，保持均衡饮食、规律作息和良好心态更有助于优生优育。建议孕前接触有害化学物质或辐射的男性进行精子质量检查，有家族遗传病史的夫妇可咨询遗传学专家。孕期通过科学方法监测胎儿健康发育比性别选择更重要，任何非医学需要的性别筛选技术均不符合伦理规范。
