碘缺乏的最大危害是影响胎儿、新生儿和婴幼儿大脑的发育。人类大脑发育的90%是在胎儿、新生儿和婴幼儿期完成的。
这个时期碘和甲状腺激素对脑细胞的发育和增生起着决定性的作用，是一生中补碘的最有效时期。缺碘使一部分人智力发育难以达到最佳水平，可有轻到中度的智力低下。世界上大范围调查显示，补碘后出生的儿童，智商明显高于未补碘的儿童，适量补碘可明显改善儿童的智力发育。
孕妇缺碘除可造成胎儿脑发育障碍外，胎儿出生后还可表现为明显的智力低下和精神运动障碍，如聋哑、偏瘫和身材矮小等典型表现的克汀病。重者，可造成畸形、早产、流产、死产及新生儿死亡。
碘是地壳中含量较少的元素之一，其含量约为0.00001%一0.00003%。世界上大多数国家的自然环境中缺碘，居民碘摄入量不足，易发生碘缺乏病。
补碘不是什么时候都可能提高智力水平的，只有在胎儿和婴幼儿期补充足够的碘，才能使他们的智力发育得以正常进行，如果错过这个时期补碘，再想提高他们的智商可能性很小。
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